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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Torreya grandis , Torreya grandis , Torreya grandis

Torreya grandis

Genome Assembly ID:t58047.G001

配列名:Tgrandis_chr

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Tgrandis_chr 系統名 wild accession
配列数 12 染色体数 n = 11
配列長 (bp) 19,052,410,213 N50長 (bp) 1,824,307,213
遺伝子の数 47,089 遺伝子数由来ファイル Tgrandis_chr.protein.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 96.5x(Illumina), 23.2x(PacBio), 106.2x(Hi-C)
アセンブリ方法 hifiasm (version 0.8-dirty-r280) 推定ゲノムサイズ (Mb) 20,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jiasheng Wu (Zhejiang A&F University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-37038-2 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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