配列名:Tgrandis_chr
ゲノム配列名 | Tgrandis_chr | 系統名 | wild accession |
配列数 | 12 | 染色体数 | n = 11 |
配列長 (bp) | 19,052,410,213 | N50長 (bp) | 1,824,307,213 |
遺伝子の数 | 47,089 | 遺伝子数由来ファイル | Tgrandis_chr.protein.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 96.5x(Illumina), 23.2x(PacBio), 106.2x(Hi-C) |
アセンブリ方法 | hifiasm (version 0.8-dirty-r280) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 20,000 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jiasheng Wu (Zhejiang A&F University) | データソース名 | Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-023-37038-2 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |