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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fragaria vesca , Wild strawberry (vesca) , イチゴ野生種 (vesca種), エゾヘビイチゴ

Fragaria vesca

Genome Assembly ID:t57918.G002

配列名:fvesca2339_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 fvesca2339_v1.0 系統名 CFRA 2339
配列数 311 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 229,483,987 N50長 (bp) 29,642,396
遺伝子の数 33,474 遺伝子数由来ファイル 2339.maker_annotation.proteins.renamed.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 120x
アセンブリ方法 Canu v1.9 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Patrick P. Edger (Michigan State University) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.3389/fgene.2021.671371 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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