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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fragaria vesca , Wild strawberry (vesca) , イチゴ野生種 (vesca種), エゾヘビイチゴ

Fragaria vesca

Genome Assembly ID:t57918.G001

配列名:Fvesca_501_v2.0.a1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Fvesca_501_v2.0.a1 系統名 Hawaii-4
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 211,673,467 N50長 (bp) 29,230,061
遺伝子の数 50,732 遺伝子数由来ファイル Fvesca_501_v2.0.a2.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 50,732 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 454, Solexa 取得した配列量 49x
アセンブリ方法 Celera Assembler v. 5.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 240
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kevin M Folta (University of Florida) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.740 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:96.3%,D:1.9%],F:0.7%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.6%[S:62.5%,D:34.1%],F:2.0%,M:1.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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