配列名:Trpr
ゲノム配列名 | Trpr | 系統名 | var. Milvus, genotype Milvus B |
配列数 | 8,595 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 304,842,038 | N50長 (bp) | 22,682,783 |
遺伝子の数 | 41,270 | 遺伝子数由来ファイル | Trifolium_pratense.Trpr.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 41,270 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq2000, Illumina MiSeq, | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | Platanus v1.2.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 420 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jose J. De Vega (The Genome Analysis Centre), Leif Skot (Aberystwyth University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/srep17394 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:91.0%[S:88.6%,D:2.4%],F:6.1%,M:2.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:89.1%[S:82.3%,D:6.8%],F:7.0%,M:3.9%,n:1614 |