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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Trifolium pratense var. Milvus , Red clover (var. Milvus) , アカクローバー, ムラサキツメクサ (Milvus変種)

Trifolium pratense

Genome Assembly ID:t57577.G001

配列名:Trpr

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Trpr 系統名 var. Milvus, genotype Milvus B
配列数 8,595 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 304,842,038 N50長 (bp) 22,682,783
遺伝子の数 41,270 遺伝子数由来ファイル Trifolium_pratense.Trpr.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 41,270 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq2000, Illumina MiSeq, 取得した配列量 100x
アセンブリ方法 Platanus v1.2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 420
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jose J. De Vega (The Genome Analysis Centre), Leif Skot (Aberystwyth University) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/srep17394 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:91.0%[S:88.6%,D:2.4%],F:6.1%,M:2.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.1%[S:82.3%,D:6.8%],F:7.0%,M:3.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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