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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Stevia rebaudiana , Candyleaf, Sweet-leaf-of-Paraguay , アマハステビア, ステビア

Stevia rebaudiana

Genome Assembly ID:t55670.G001

配列名:Stevia_rebaudiana_genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Stevia_rebaudiana_genome 系統名 cv. Zhongshan No.7
配列数 3,708 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 1,416,115,052 N50長 (bp) 106,552,653
遺伝子の数 44,143 遺伝子数由来ファイル Stevia_rebaudiana_pep.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Ilumina Hiseq and PacBio 取得した配列量 99.53x
アセンブリ方法 Canu v1.5, WTDBG v1.2.8, FALCON v0.7, Quickmerge,Pilon 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,160
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yongheng Yang (Institute of Botany, Jiangsu Province) データソース名 figshare database
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00565-4 データソースURL https://figshare.com/articles/dataset/Stevia_rebaudiana_genome_data/14169491/1
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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