配列名:Stevia_rebaudiana_genome
ゲノム配列名 | Stevia_rebaudiana_genome | 系統名 | cv. Zhongshan No.7 |
配列数 | 3,708 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 1,416,115,052 | N50長 (bp) | 106,552,653 |
遺伝子の数 | 44,143 | 遺伝子数由来ファイル | Stevia_rebaudiana_pep.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Ilumina Hiseq and PacBio | 取得した配列量 | 99.53x |
アセンブリ方法 | Canu v1.5, WTDBG v1.2.8, FALCON v0.7, Quickmerge,Pilon | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,160 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yongheng Yang (Institute of Botany, Jiangsu Province) | データソース名 | figshare database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-021-00565-4 | データソースURL | https://figshare.com/articles/dataset/Stevia_rebaudiana_genome_data/14169491/1 |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |