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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Dioscorea alata , Water yam , ダイジョ

Dioscorea alata

Genome Assembly ID:t55571.G001

配列名:Dalata_550_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Dalata_550_v2.0 系統名 TDa95/00328
配列数 25 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 480,026,477 N50長 (bp) 23,984,514
遺伝子の数 25,189 遺伝子数由来ファイル Dalata_550_v2.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 234x
アセンブリ方法 Canu v1.7 推定ゲノムサイズ (Mb) 477
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Daniel S. Rokhsar (University of California University of California Berkeley) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-29114-w データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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