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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus unshiu , Satsuma orange, Satsuma mandarin , ウンシュウミカン

Citrus unshiu

Genome Assembly ID:t55188.G004

配列名:CUNphKu_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CUNphKu_r1.0 系統名 Miyagawa wase
配列数 10 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 358,051,941 N50長 (bp) 44,176,352
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 42.4X
アセンブリ方法 TioCanu, Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 364
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Phased genome, Kunenbo haploid
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2023.06.02.543356 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 3.0.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.3%[S:94.6%,D:1.7%],F:1.0%,M:2.7%,n:1375 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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