配列名:v1.0
ゲノム配列名 | v1.0 | 系統名 | cv. Miyagawa wase; NIAS Genebank registration number 117351 |
配列数 | 3,151 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 346,435,163 | N50長 (bp) | 206,057 |
遺伝子の数 | 42,913 | 遺伝子数由来ファイル | C_unshiu_v1.0_protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq 2000, PacBio RSII | 取得した配列量 | 288x(Illumina), 23x(PacBio) |
アセンブリ方法 | Platanus v1.2.4, DBG2OLC | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 336 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Takehiko Shimada (National Agriculture and Food Research Organization Institute of Fruit and Tea Tree Science) | データソース名 | Mikan Genome DB |
論文 (DOIコード) | 10.1270/jsbbs.19097 | データソースURL | https://mikan.dna.affrc.go.jp |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |