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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus unshiu , Satsuma orange, Satsuma mandarin , ウンシュウミカン

Citrus unshiu

Genome Assembly ID:t55188.G001

配列名:v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 v1.0 系統名 cv. Miyagawa wase; NIAS Genebank registration number 117351
配列数 3,151 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 346,435,163 N50長 (bp) 206,057
遺伝子の数 42,913 遺伝子数由来ファイル C_unshiu_v1.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq 2000, PacBio RSII 取得した配列量 288x(Illumina), 23x(PacBio)
アセンブリ方法 Platanus v1.2.4, DBG2OLC 推定ゲノムサイズ (Mb) 336
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takehiko Shimada (National Agriculture and Food Research Organization Institute of Fruit and Tea Tree Science) データソース名 Mikan Genome DB
論文 (DOIコード) 10.1270/jsbbs.19097 データソースURL https://mikan.dna.affrc.go.jp
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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