配列名:LKA_r1.0
ゲノム配列名 | LKA_r1.0 | 系統名 | GFE32203 |
配列数 | 4,655 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 13,492,429,495 | N50長 (bp) | 15,952,621 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 32x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 7,946 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | BreedingTrees-by-Genes |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2022.11.16.516598 | データソースURL | https://btg.kazusa.or.jp |
BUSCO バージョン | 5.0.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:89.1%[S:77.5%,D:11.6%],F:6.8%,M:4.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |