配列名:BananaB_V1
ゲノム配列名 | BananaB_V1 | 系統名 | DH-PKW |
配列数 | 378 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 457,197,862 | N50長 (bp) | 41,415,055 |
遺伝子の数 | 33,021 | 遺伝子数由来ファイル | Musba_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,021 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel | 取得した配列量 | 113.0x |
アセンブリ方法 | wtdbg v. 1.2.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 438 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A double haploid of the wild diploid genotype Pisang Klutuk Wulung. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Angelique D'Hont (Montpellier SupAgro), Wei Hu (Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences), Zhiqiang Jin (ditto) | データソース名 | Banana Genome Hub |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-019-0452-6 | データソースURL | https://banana-genome-hub.southgreen.fr/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.0%[S:92.3%,D:4.7%],F:1.1%,M:1.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:87.4%[S:83.4%,D:4.0%],F:4.2%,M:8.4%,n:1614 |