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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Musa balbisiana , Wild banana (balbisiana) , バナナ野生種 (balbisiana種), リュウキュウバショウ

Musa balbisiana

Genome Assembly ID:t52838.G001

配列名:BananaB_V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 BananaB_V1 系統名 DH-PKW
配列数 378 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 457,197,862 N50長 (bp) 41,415,055
遺伝子の数 33,021 遺伝子数由来ファイル Musba_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 33,021 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 113.0x
アセンブリ方法 wtdbg v. 1.2.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 438
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A double haploid of the wild diploid genotype Pisang Klutuk Wulung.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Angelique D'Hont (Montpellier SupAgro), Wei Hu (Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences), Zhiqiang Jin (ditto) データソース名 Banana Genome Hub
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-019-0452-6 データソースURL https://banana-genome-hub.southgreen.fr/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.0%[S:92.3%,D:4.7%],F:1.1%,M:1.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:87.4%[S:83.4%,D:4.0%],F:4.2%,M:8.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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