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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eustoma grandiflorum , lisianthus, Bluebell, Prairie gentian , トルコギキョウ

Eustoma grandiflorum

Genome Assembly ID:t52518.G002

配列名:Eustoma

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Eustoma 系統名 NA
配列数 353 染色体数 2n = 6x = 72
配列長 (bp) 1,708,239,914 N50長 (bp) 36,170,991
遺伝子の数 54,305 遺伝子数由来ファイル Eustoma.final.longest.nr.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 23.56x (PacBio), 103.04x (Hi-C)
アセンブリ方法 Canu v1.5, BWA-MEM v0.7.17, Juicer v1.5.6, 3D-DNA v180922 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jihua Wang (Yunnan Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13899 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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