配列名:Egra_v1.0
ゲノム配列名 | Egra_v1.0 | 系統名 | 10B-620 |
配列数 | 100 | 染色体数 | 2n = 2x = 72 |
配列長 (bp) | 1,324,827,894 | N50長 (bp) | 35,699,481 |
遺伝子の数 | 36,619 | 遺伝子数由来ファイル | Egra_v1.0_pep_HC.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 36,619 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sequel, Hi-C | 取得した配列量 | 65.8x |
アセンブリ方法 | Falcon Unzip, Proximo, Allmaps | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,588 |
シーケンシングの方法のコメント | Use liknkage map for pseudomolecule construction | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.09.09.459690 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.6%[S:81.9%,D:14.7%],F:1.5%,M:1.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.0%[S:63.8%,D:30.2%],F:3.3%,M:2.7%,n:1614 |