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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Eustoma grandiflorum , lisianthus, Bluebell, Prairie gentian , トルコギキョウ

Eustoma grandiflorum

Genome Assembly ID:t52518.G001

配列名:Egra_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Egra_v1.0 系統名 10B-620
配列数 100 染色体数 2n = 2x = 72
配列長 (bp) 1,324,827,894 N50長 (bp) 35,699,481
遺伝子の数 36,619 遺伝子数由来ファイル Egra_v1.0_pep_HC.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 36,619 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sequel, Hi-C 取得した配列量 65.8x
アセンブリ方法 Falcon Unzip, Proximo, Allmaps 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,588
シーケンシングの方法のコメント Use liknkage map for pseudomolecule construction コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.09.09.459690 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.6%[S:81.9%,D:14.7%],F:1.5%,M:1.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.0%[S:63.8%,D:30.2%],F:3.3%,M:2.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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