配列名:EG5
ゲノム配列名 | EG5 | 系統名 | AVROS pisifera |
配列数 | 40,061 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 1,535,178,229 | N50長 (bp) | 1,268,079 |
遺伝子の数 | 43,551 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_000442705.1_EG5_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 43,551 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | 454 | 取得した配列量 | 26x |
アセンブリ方法 | Newbler v. 2.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,800 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | 'AVROS pisifera' fruit-form |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Robert A. Martienssen (Cold Spring Harbor Laboratory), Rajinder Singh (Malaysian Palm Oil Board) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature12309 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.2%[S:91.2%,D:6.0%],F:1.7%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.8%[S:52.9%,D:45.9%],F:0.4%,M:0.8%,n:1614 |