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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Elaeis guineensis , African oil palm , アブラヤシ

Elaeis guineensis

Genome Assembly ID:t51953.G001

配列名:EG5

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 EG5 系統名 AVROS pisifera
配列数 40,061 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 1,535,178,229 N50長 (bp) 1,268,079
遺伝子の数 43,551 遺伝子数由来ファイル GCF_000442705.1_EG5_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 43,551 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 454 取得した配列量 26x
アセンブリ方法 Newbler v. 2.6 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,800
シーケンシングの方法のコメント NA コメント 'AVROS pisifera' fruit-form
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Robert A. Martienssen (Cold Spring Harbor Laboratory), Rajinder Singh (Malaysian Palm Oil Board) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/nature12309 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.2%[S:91.2%,D:6.0%],F:1.7%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.8%[S:52.9%,D:45.9%],F:0.4%,M:0.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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