配列名:Walnut2.0
ゲノム配列名 | Walnut2.0 | 系統名 | Chandler |
配列数 | 24,757 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 572,946,670 | N50長 (bp) | 37,114,715 |
遺伝子の数 | 45,959 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_001411555.2_Walnut_2.0_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | llumina HiSeq; Oxford Nanopore MinION; Illumina NovaSeq | 取得した配列量 | 155.0x |
アセンブリ方法 | MaSuRCA v. 3.2.1; HiRise v. 2018-04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 606 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Annarita Marrano (University of California) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giaa050 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.0%[S:91.6%,D:7.4%],F:0.7%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.6%[S:59.1%,D:40.5%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 |