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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Juglans regia , English walnut , カシグルミ, テウチグルミ, セイヨウグルミ

Juglans regia

Genome Assembly ID:t51240.G001

配列名:Walnut2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Walnut2.0 系統名 Chandler
配列数 24,757 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 572,946,670 N50長 (bp) 37,114,715
遺伝子の数 45,959 遺伝子数由来ファイル GCF_001411555.2_Walnut_2.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 llumina HiSeq; Oxford Nanopore MinION; Illumina NovaSeq 取得した配列量 155.0x
アセンブリ方法 MaSuRCA v. 3.2.1; HiRise v. 2018-04 推定ゲノムサイズ (Mb) 606
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Annarita Marrano (University of California) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giaa050 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.0%[S:91.6%,D:7.4%],F:0.7%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.6%[S:59.1%,D:40.5%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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