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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Crataegus pinnatifida var. major , Hawthorn (var. major) , オオサンザシ (major変種)

Crataegus pinnatifida

Genome Assembly ID:t510735.G001

配列名:Cpinnatifida_major_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Cpinnatifida_major_v1.0 系統名 var. major, cv. Qiu Jinxing
配列数 18 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 823,484,868 N50長 (bp) 44,939,242
遺伝子の数 40,571 遺伝子数由来ファイル hawthorn.LG.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 242.68x
アセンブリ方法 wtdbg2 v2.4 推定ゲノムサイズ (Mb) 857
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wenxuan Dong (Shenyang Agricultural University) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1111/jipb.13318 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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