配列名:MPIPZ.v5
ゲノム配列名 | MPIPZ.v5 | 系統名 | cv. Pajares |
配列数 | 926 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 336,719,365 | N50長 (bp) | 36,598,175 |
遺伝子の数 | 39,815 | 遺伝子数由来ファイル | A_alpina_V4.protein.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 39,815 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454, Sanger | 取得した配列量 | 86x |
アセンブリ方法 | Newbler v. 2.9, SSPACE v. 1.2, BAMBUS v. 2.33 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 375 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Korbinian Schneeberger (schneeberger@mpipz.mpg.de), George Coupland (coupland@mpipz.mpg.de) | データソース名 | Genomic resources for Arabis alpina |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nplants.2014.23 | データソースURL | http://www.arabis-alpina.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:96.3%,D:3.0%],F:0.4%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.7%[S:87.9%,D:8.8%],F:1.8%,M:1.5%,n:1614 |