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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Erianthus arundinaceus , Erianthus, Sweetcane , エリアンサス

Erianthus arundinaceus

Genome Assembly ID:t50346.G001

配列名:EARuph_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 EARuph_r1.0 系統名 JW4
配列数 10 染色体数 2n = 6x = 60
配列長 (bp) 1,296,350,803 N50長 (bp) 130,135,155
遺伝子の数 59,131 遺伝子数由来ファイル EARuph_r1.0.pmol_pep_HC.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, MP, 10XGenomics, PacBio CCS 取得した配列量 293X
アセンブリ方法 DenovoMAGIC 3.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 6,000
シーケンシングの方法のコメント コメント Unphased genome, Synonym: Tripidium arundinaceum
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst, University of Tokyo) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) in preparation データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.8%[S:80.3%,D:16.5%],F:0.6%,M:2.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.5%[S:77.9%,D:15.6%],F:1.1%,M:5.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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