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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cinchona pubescens , Quinine, Red cinchona , アカキナノキ

Cinchona pubescens

Genome Assembly ID:t50278.G001

配列名:mergedAss_sizeSelec_4PAD_P9018_3KbpINSERT_raconPOLISH

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 mergedAss_sizeSelec_4PAD_P9018_3KbpINSERT_raconPOLISH 系統名 accession number 1977-69
配列数 603 染色体数 2n = 34
配列長 (bp) 904,448,341 N50長 (bp) 2,802,128
遺伝子の数 72,305 遺伝子数由来ファイル mergedAss_P9018_3KbpINSERT_raconPOLISH_longer.aa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Illumina 取得した配列量 218x (Oxford Nanopore), 300x (Illumina)
アセンブリ方法 SMARTdenovo v.1.0, RACON v.1.4.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Combination of Oxford Nanopore and short-read Illumina
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ilia J. Leitch (Royal Botanic Gardens) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.46471/gigabyte.71 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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