配列名:NIATTr2
ゲノム配列名 | NIATTr2 | 系統名 | ecotype Utah, UT |
配列数 | 37,194 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 2,365,682,703 | N50長 (bp) | 524,499 |
遺伝子の数 | 33,320 | 遺伝子数由来ファイル | Nicotiana_attenuata.NIATTr2.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,320 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, 454 | 取得した配列量 | 30x |
アセンブリ方法 | Celera Assembler v. 7 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,500 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shuqing Xua (Max Planck Institute for Chemical Ecology), Ian T. Baldwin (ditto), Emmanuel Gaquerelb (University of Heidelberg) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1073/pnas.1700073114 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:96.2%,D:2.4%],F:0.9%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:92.8%[S:90.4%,D:2.4%],F:3.4%,M:3.8%,n:1614 |