配列名:AUK_PRJEB4211_v1
ゲノム配列名 | AUK_PRJEB4211_v1 | 系統名 | DH200-94 |
配列数 | 13,007 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 568,611,505 | N50長 (bp) | 29,137,935 |
遺伝子の数 | 25,574 | 遺伝子数由来ファイル | Coffea_canephora.AUK_PRJEB4211_v1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 25,574 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | illumina, Roche 454 | 取得した配列量 | 24x |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 710 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A doubled-haploid line |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Victor A. Albert (University at Buffalo), Patrick Wincker (Institut de Genomique), Philippe Lashermes (Centre de Cooperation Internationale en Recherche Agronomique pour le Developpement (CIRAD), IRD, UM2)) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.1255274 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:96.8%,D:1.2%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.2%[S:92.9%,D:1.3%],F:3.8%,M:2.0%,n:1614 |