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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Anthoceros angustus , Anthoceros angustus , ホウライツノゴケ

Anthoceros angustus

Genome Assembly ID:t48387.G001

配列名:Anthoceros.angustus.sccafold

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Anthoceros.angustus.sccafold 系統名 W1879-2010-01-18
配列数 289 染色体数 NA
配列長 (bp) 119,348,994 N50長 (bp) 1,092,075
遺伝子の数 14,629 遺伝子数由来ファイル Anthoceros.angustus.coding.gene.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore 取得した配列量 17.10_Gb(Illumina),3.78 Gb(Oxford Nanopore)
アセンブリ方法 wtdbg-1.2.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 107
シーケンシングの方法のコメント For whole-genome shotgun sequencing, ten sequencing libraries with insert sizes with 170, 250, 350, 500, 800, 2k, 5k, 10k, 20k, and 40k bp were generated コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhi-Duan Chen (Chinese Academy of Sciences) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-019-0588-4 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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