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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Perilla frutescens var. hirtella , Perilla, Lemon egoma , レモンエゴマ

Perilla frutescens

Genome Assembly ID:t48386.G006

配列名:ICMM_Pcit_2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ICMM_Pcit_2.0 系統名 wild line PC02
配列数 1,789 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 676,940,316 N50長 (bp) 64,469,250
遺伝子の数 23,675 遺伝子数由来ファイル GCA_019512045.2_ICMM_Pcit_2.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 23,675 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel I 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Canu v1.5 推定ゲノムサイズ (Mb) 680
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Perilla citriodora, Perilla frutescens var.citriodora
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shilin Chen (China Academy of Chinese Medical Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-25681-6 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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