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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Perilla frutescens , Perilla, Shiso, Egoma, Lemon egoma, Beefsteak plant , シソ, エゴマ, レモンエゴマ

Perilla frutescens

Genome Assembly ID:t48386.G005

配列名:Pfru_SekihoUp_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pfru_SekihoUp_1.0 系統名 SekihoS8 (Red perilla)
配列数 20 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 1,259,754,514 N50長 (bp) 63,696,810
遺伝子の数 65,161 遺伝子数由来ファイル Pfru_SekihoUp_helixer.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 65,161 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 29.1x
アセンブリ方法 Hifiasm, Ragoo against Pfru_yukari_1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,250
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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