配列名:Pfru_SekihoH2_1.0
ゲノム配列名 | Pfru_SekihoH2_1.0 | 系統名 | SekihoS8 (Red perilla) |
配列数 | 20 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
配列長 (bp) | 1,231,843,663 | N50長 (bp) | 63,607,629 |
遺伝子の数 | 62,895 | 遺伝子数由来ファイル | Pfru_SekihoH2_helixer.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 62,895 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi | 取得した配列量 | 29.1x |
アセンブリ方法 | Hifiasm, Ragoo against Pfru_yukari_1.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,250 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |