配列名:GCA_026008535.1_Pfru_yukari_1.0
ゲノム配列名 | GCA_026008535.1_Pfru_yukari_1.0 | 系統名 | cv. Hoko-3 (Red perilla) |
配列数 | 71 | 染色体数 | 2n = 4x = 40 |
配列長 (bp) | 1,258,994,547 | N50長 (bp) | 63,334,402 |
遺伝子の数 | 107,631 | 遺伝子数由来ファイル | yukari_merged_gff_Pfg.protein.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 107,631 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Omni-C | 取得した配列量 | 57.5x(PacBio) |
アセンブリ方法 | Hifiasm v0.16.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hidemasa Bono (Hiroshima University ) | データソース名 | FigShare |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsac044 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |