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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Perilla frutescens , Perilla, Shiso, Egoma, Lemon egoma, Beefsteak plant , シソ, エゴマ, レモンエゴマ

Perilla frutescens

Genome Assembly ID:t48386.G002

配列名:GCA_026008535.1_Pfru_yukari_1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_026008535.1_Pfru_yukari_1.0 系統名 cv. Hoko-3 (Red perilla)
配列数 71 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 1,258,994,547 N50長 (bp) 63,334,402
遺伝子の数 107,631 遺伝子数由来ファイル yukari_merged_gff_Pfg.protein.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 107,631 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Omni-C 取得した配列量 57.5x(PacBio)
アセンブリ方法 Hifiasm v0.16.1 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hidemasa Bono (Hiroshima University ) データソース名 FigShare
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsac044 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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