Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Perilla frutescens var. frutescens , Egoma, Perilla mint, Oilseed perilla, Beefsteak plant , エゴマ

Perilla frutescens

Genome Assembly ID:t48386.G001

配列名:ICMM_Pfru_2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ICMM_Pfru_2.0 系統名 var. frutescens, cv. PF40
配列数 1,465 染色体数 2n = 4x = 40
配列長 (bp) 1,234,370,464 N50長 (bp) 62,644,896
遺伝子の数 38,941 遺伝子数由来ファイル GCA_019511825.2_ICMM_Pfru_2.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 38,941 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel I 取得した配列量 54.5x
アセンブリ方法 Canu v1.5 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,240
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Ocimum frutescens
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shilin Chen (China Academy of Chinese Medical Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-25681-6 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット