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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrus nobilis , King of Siam, kunembo, tangor , クネンボ

Citrus nobilis

Genome Assembly ID:t481549.G003

配列名:CKUhap2_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CKUhap2_r1.0 系統名 NIAS Genebank 117387
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 303,348,332 N50長 (bp) 32,965,372
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Omni-C 取得した配列量 29.9X
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 372
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Phased genome, hap2
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2023.06.02.543356 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 3.0.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.8%[S:96.6%,D:1.2%],F:0.4%,M:1.8%,n:1375 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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