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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Acer pseudosieboldianum , Korean maple , チョウセンハウチワカエデ

Acer pseudosieboldianum

Genome Assembly ID:t47968.G001

配列名:GWHBECT00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBECT00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 44 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 690,370,816 N50長 (bp) 48,866,705
遺伝子の数 32,430 遺伝子数由来ファイル GWHBECT00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 30.37x(PacBio), 85.55x(Illumina), 63.75Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 HiFiasm v.0.2.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 558
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xiaona Pei (Jilin Agricultural University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2022.850054 データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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