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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Acer truncatum , Purpleblow maple , マンシュウイタヤ

Acer truncatum

Genome Assembly ID:t47965.G001

配列名:version 2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 version 2 系統名 NA
配列数 34 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 633,281,485 N50長 (bp) 46,359,076
遺伝子の数 28,438 遺伝子数由来ファイル Acer_truncatum.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 115.85x
アセンブリ方法 Falcon 推定ゲノムサイズ (Mb) 633
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xing Zhao(Novogene Bioinformatics Institute), Qianzhong Li(Institute of Leisure Agriculture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement) データソース名 figshare Medicinal Plants multi-Omics Database, MPOD
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.14954 データソースURL https://doi.org/10.6084/m9.figshare.12986237.v2 http://biobd.ynau.edu.cn/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:88.5%,D:9.2%],F:0.9%,M:1.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.0%[S:80.7%,D:8.3%],F:6.6%,M:4.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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