Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Typha latifolia , Typha latifolia , ガマ

Typha latifolia

Genome Assembly ID:t4733.G001

配列名:GCA_019914945.1_TyphaL0001_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_019914945.1_TyphaL0001_genomic 系統名 wild accession
配列数 81 染色体数 NA
配列長 (bp) 214,326,387 N50長 (bp) 14,472,745
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 138.6_Gb(Illumina), 86.8_Gb(PacBio)
アセンブリ方法 ABySS _v2.2.4 & Canu _v2.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 257
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Aaron B A Shafer (Trent University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkab401 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット