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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Thalictrum thalictroides , Thalictrum thalictroides , バイカカラマツソウ

Thalictrum thalictroides

Genome Assembly ID:t46969.G001

配列名:GCA_013358455.1_MaSuRCA_all.p2_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_013358455.1_MaSuRCA_all.p2_genomic 系統名 TtWT478 and TtWT964
配列数 44,860 染色体数 NA
配列長 (bp) 243,091,176 N50長 (bp) 9,811
遺伝子の数 33,624 遺伝子数由来ファイル GCA_013358455.1_MaSuRCA_all.p2_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 8.8 Gb
アセンブリ方法 MaSuRCA version 3.2.9 推定ゲノムサイズ (Mb) 286
シーケンシングの方法のコメント Library was generated for each accession, respectively コメント In this paper, draft genome of two accession were assembled independently. Then, consensus sequence of those was adopted as a draft or reference genome
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Veronica S. Di Stilio (University of Washington) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1002/aps3.11407 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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