配列名:Aofficinalis_498_Aspof.V1
ゲノム配列名 | Aofficinalis_498_Aspof.V1 | 系統名 | genotype male |
配列数 | 11,799 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 1,187,539,004 | N50長 (bp) | 131,339,754 |
遺伝子の数 | 27,395 | 遺伝子数由来ファイル | Aofficinalis_498_V1.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 27,395 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 123.0x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo2 v. r240; PBjelly v. 14.9.9 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,300 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A doubled haploid male genotype |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yin Ye (BGI-Shenzhen), James H. Leebens-Mack (University of Georgia), Guangyu Chen (Jiangxi Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-017-01064-8 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:91.9%[S:88.8%,D:3.1%],F:4.3%,M:3.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:78.8%[S:76.0%,D:2.8%],F:10.7%,M:10.5%,n:1614 |