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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Asparagus officinalis , Garden asparagus , アスパラガス

Asparagus officinalis

Genome Assembly ID:t4686.G001

配列名:Aofficinalis_498_Aspof.V1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Aofficinalis_498_Aspof.V1 系統名 genotype male
配列数 11,799 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 1,187,539,004 N50長 (bp) 131,339,754
遺伝子の数 27,395 遺伝子数由来ファイル Aofficinalis_498_V1.1.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 27,395 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 123.0x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 v. r240; PBjelly v. 14.9.9 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,300
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A doubled haploid male genotype
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yin Ye (BGI-Shenzhen), James H. Leebens-Mack (University of Georgia), Guangyu Chen (Jiangxi Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-017-01064-8 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:91.9%[S:88.8%,D:3.1%],F:4.3%,M:3.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:78.8%[S:76.0%,D:2.8%],F:10.7%,M:10.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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