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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ficus hispida , Fig , イチジク野生種 (hispida種)

Ficus hispida

Genome Assembly ID:t462830.G001

配列名:GWHALOG00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHALOG00000000 系統名 NA
配列数 394 染色体数 2n = 28
配列長 (bp) 369,753,424 N50長 (bp) 24,073,434
遺伝子の数 27,210 遺伝子数由来ファイル GWHALOG00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Pacbio RSII, Hi-C 取得した配列量 97.69x (PacBio), 74.78x (Hi-C)
アセンブリ方法 CANU v1.7, SMARTdenov, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 436
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ray Ming (University of Illinois at Urbana-Champaign) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.cell.2020.09.043 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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