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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ananas comosus var. MD-2 , Pineapple (var. MD-2) , パイナップル (MD-2変種)

Ananas comosus

Genome Assembly ID:t4615.G004

配列名:ACMD2v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ACMD2v1.0 系統名 variety MD-2
配列数 8,448 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 524,069,662 N50長 (bp) 153,084
遺伝子の数 23,598 遺伝子数由来ファイル GCA_001661175.1_ACMD2v1.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio RSII 取得した配列量 154.7x (Illumina), 15.9x (PacBio)
アセンブリ方法 Celera v8.3rc1, SSPACE-LongRead 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 S. Vijay Kumar (University Malaysia Sabah) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsw026 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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