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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ananas comosus , Pineapple , パイナップル

Ananas comosus

Genome Assembly ID:t4615.G003

配列名:ACO_r3.3H.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ACO_r3.3H.pmol 系統名 Yugafu, HI101 haplotype
配列数 25 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 401,640,934 N50長 (bp) 15,497,171
遺伝子の数 45,983 遺伝子数由来ファイル ACO_r3.3H.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 48x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,164
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenji Nashima (Nihon University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15699 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:91.3%[S:81.8%,D:9.5%],F:1.8%,M:6.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:75.0%[S:67.3%,D:7.7%],F:7.9%,M:17.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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