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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ananas comosus , Pineapple , パイナップル

Ananas comosus

Genome Assembly ID:t4615.G002

配列名:ACO_r3.3C.pmol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ACO_r3.3C.pmol 系統名 Yugafu, Cream pineapple haplotype
配列数 25 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 431,138,038 N50長 (bp) 17,173,289
遺伝子の数 49,334 遺伝子数由来ファイル ACO_r3.3C.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 48x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,164
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenji Nashima (Nihon University) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15699 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.0%[S:82.4%,D:13.6%],F:1.4%,M:2.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:78.7%[S:67.9%,D:10.8%],F:8.1%,M:13.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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