配列名:ACO_r3.3C.pmol
ゲノム配列名 | ACO_r3.3C.pmol | 系統名 | Yugafu, Cream pineapple haplotype |
配列数 | 25 | 染色体数 | 2n = 2x = 50 |
配列長 (bp) | 431,138,038 | N50長 (bp) | 17,173,289 |
遺伝子の数 | 49,334 | 遺伝子数由来ファイル | ACO_r3.3C.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 48x |
アセンブリ方法 | Falcon_Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,164 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenji Nashima (Nihon University) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.15699 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.0%[S:82.4%,D:13.6%],F:1.4%,M:2.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:78.7%[S:67.9%,D:10.8%],F:8.1%,M:13.2%,n:1614 |