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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ananas comosus var. F153 , Pineapple (var. F153) , パイナップル (F153変種)

Ananas comosus

Genome Assembly ID:t4615.G001

配列名:Acomosus_321_v3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Acomosus_321_v3 系統名 var. F153
配列数 3,133 染色体数 2n = 2x = 50
配列長 (bp) 381,905,120 N50長 (bp) 11,759,267
遺伝子の数 27,024 遺伝子数由来ファイル Acomosus_321_v3.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 27,024 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, 454 取得した配列量 400x
アセンブリ方法 AllPaths v. OCT-2012 推定ゲノムサイズ (Mb) 526
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ray Ming (Fujian Agriculture and Forestry University), Robert E Paull (University of Hawaii), Qingyi Yu (Texas A&M University System) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3435 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:94.4%,D:4.0%],F:1.2%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.3%[S:85.5%,D:3.8%],F:3.7%,M:7.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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