配列名:Acomosus_321_v3
ゲノム配列名 | Acomosus_321_v3 | 系統名 | var. F153 |
配列数 | 3,133 | 染色体数 | 2n = 2x = 50 |
配列長 (bp) | 381,905,120 | N50長 (bp) | 11,759,267 |
遺伝子の数 | 27,024 | 遺伝子数由来ファイル | Acomosus_321_v3.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 27,024 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, 454 | 取得した配列量 | 400x |
アセンブリ方法 | AllPaths v. OCT-2012 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 526 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Ray Ming (Fujian Agriculture and Forestry University), Robert E Paull (University of Hawaii), Qingyi Yu (Texas A&M University System) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.3435 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.4%[S:94.4%,D:4.0%],F:1.2%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:89.3%[S:85.5%,D:3.8%],F:3.7%,M:7.0%,n:1614 |