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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Phoebe bournei , Nanmu , クスノキ, フィービー・バーネイ

Phoebe bournei

Genome Assembly ID:t460784.G002

配列名:Pbournei.v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pbournei.v1 系統名 NA
配列数 85 染色体数 2n = 24
配列長 (bp) 1,065,919,434 N50長 (bp) 97,005,682
遺伝子の数 30,096 遺伝子数由来ファイル Pbournei.v1.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS II, BioNano optical mapping, Hi-C 取得した配列量 117.11 Gb (PacBio), 272.26 Gb (BioNano), 350.62 Gb (Hi-C)
アセンブリ方法 FALCON v.1.8.7, PBJelly v.15.8.24, Bowtie2 v2.3.2, LACHESIS 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,078
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zaikang Tong (Zhejiang A&F University) データソース名 China National GeneBank DataBase (CNGB)
論文 (DOIコード) 10.1016/j.xplc.2022.100410 データソースURL https://db.cngb.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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