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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Aegilops speltoides , Goat grass , クサビコムギ, コムギ近縁野生種

Aegilops speltoides

Genome Assembly ID:t4573.G001

配列名:GWHBFXR00000000.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBFXR00000000.1 系統名 NA
配列数 10,842 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 4,110,737,152 N50長 (bp) 530,918,953
遺伝子の数 37,567 遺伝子数由来ファイル GWHBFXR00000000.1.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 37,567 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 WTDBG2 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,600
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Bao Liu (Northeast Normal University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2021.12.019 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.0%[S:91.6%,D:4.4%],F:0.9%,M:3.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.1%[S:89.3%,D:3.8%],F:0.4%,M:6.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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