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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Triticum turgidum , Durum wheat , コムギ (turgidum種), デュラムコムギ, マカロニコムギ

Triticum turgidum

Genome Assembly ID:t4571.G001

配列名:Svevo.v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Svevo.v1 系統名 cv. Svevo
配列数 15 染色体数 2n = 4x = 28
配列長 (bp) 10,463,058,104 N50長 (bp) 722,970,987
遺伝子の数 196,105 遺伝子数由来ファイル Triticum_turgidum.Svevo.v1.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 196,105 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 NA 取得した配列量 270x
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 12,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Klaus F. X. Mayer (Helmholtz Zentrum Munchen), Aldo Ceriotti (National Research Council - Institute of Agricultural Biology and Biotechnology), Curtis J. Pozniak (University of Saskatchewan), Luigi Cattivelli (CREA - Research Centre for Genomics and Bioinformatics) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0381-3 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:12.7%,D:85.8%],F:0.7%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.8%[S:7.6%,D:89.2%],F:1.1%,M:2.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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