配列名:kariega_v1
ゲノム配列名 | kariega_v1 | 系統名 | cv. Kariega |
配列数 | 22 | 染色体数 | 2n = 6x = 42 |
配列長 (bp) | 14,677,204,660 | N50長 (bp) | 717,109,572 |
遺伝子の数 | 990,637 | 遺伝子数由来ファイル | Kariega_v1-prot.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, optical map, Omni-C(Illumina) | 取得した配列量 | 34x (PacBio), 180x (optical map) |
アセンブリ方法 | hifiasm v.0.11, Bionano Solve 3.6, Juicer v.1.6, 3D-DNA v.180114 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Simon G. Krattinger (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)) | データソース名 | DRYAD |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-022-01022-1 | データソースURL | https://datadryad.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |