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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Triticum aestivum , Bread wheat, African bread wheat , コムギ (aestivum種), パンコムギ

Triticum aestivum

Genome Assembly ID:t4565.G003

配列名:kariega_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 kariega_v1 系統名 cv. Kariega
配列数 22 染色体数 2n = 6x = 42
配列長 (bp) 14,677,204,660 N50長 (bp) 717,109,572
遺伝子の数 990,637 遺伝子数由来ファイル Kariega_v1-prot.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, optical map, Omni-C(Illumina) 取得した配列量 34x (PacBio), 180x (optical map)
アセンブリ方法 hifiasm v.0.11, Bionano Solve 3.6, Juicer v.1.6, 3D-DNA v.180114 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Simon G. Krattinger (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-022-01022-1 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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