配列名:iwgsc_refseqv1.0
ゲノム配列名 | iwgsc_refseqv1.0 | 系統名 | cv Chinese Spring |
配列数 | 22 | 染色体数 | 2n = 6x = 42 |
配列長 (bp) | 14,547,261,565 | N50長 (bp) | 709,773,743 |
遺伝子の数 | 133,346 | 遺伝子数由来ファイル | Triticum_aestivum.IWGSC.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 133,346 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | illumina,Hi-C | 取得した配列量 | 234x |
アセンブリ方法 | deNovoMagic2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 16,944 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC), Rudi Appels (La Trobe University), Kellye Eversole (IWGSC), Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.aar7191 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.0%[S:3.5%,D:95.5%],F:0.5%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.2%[S:1.1%,D:98.1%],F:0.1%,M:0.7%,n:1614 |