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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Triticum aestivum , Bread wheat, African bread wheat , コムギ (aestivum種), パンコムギ

Triticum aestivum

Genome Assembly ID:t4565.G001

配列名:iwgsc_refseqv1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 iwgsc_refseqv1.0 系統名 cv Chinese Spring
配列数 22 染色体数 2n = 6x = 42
配列長 (bp) 14,547,261,565 N50長 (bp) 709,773,743
遺伝子の数 133,346 遺伝子数由来ファイル Triticum_aestivum.IWGSC.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 133,346 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 illumina,Hi-C 取得した配列量 234x
アセンブリ方法 deNovoMagic2 推定ゲノムサイズ (Mb) 16,944
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC), Rudi Appels (La Trobe University), Kellye Eversole (IWGSC), Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1126/science.aar7191 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.0%[S:3.5%,D:95.5%],F:0.5%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.2%[S:1.1%,D:98.1%],F:0.1%,M:0.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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