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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Echinochloa phyllopogon , Rice barnyardgrass , タイヌビエ (phyllopogon種)

Echinochloa phyllopogon

Genome Assembly ID:t45619.G001

配列名:EPH_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 EPH_r1.1 系統名 R511
配列数 19 染色体数 2n = 4X = 18
配列長 (bp) 1,002,757,761 N50長 (bp) 58,069,259
遺伝子の数 64,805 遺伝子数由来ファイル Eph1.1.high.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 64,805 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, genetic mapping 取得した配列量 66.9X
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,028
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Mitsuhiko P. Sato (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2023.05.23.541891 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.0.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:9.4%,D:89.5%],F:0.6%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.1%[S:15.7%,D:79.4%],F:1.7%,M:3.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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