配列名:EPH_r1.1
ゲノム配列名 | EPH_r1.1 | 系統名 | R511 |
配列数 | 19 | 染色体数 | 2n = 4X = 18 |
配列長 (bp) | 1,002,757,761 | N50長 (bp) | 58,069,259 |
遺伝子の数 | 64,805 | 遺伝子数由来ファイル | Eph1.1.high.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 64,805 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi, genetic mapping | 取得した配列量 | 66.9X |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,028 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Mitsuhiko P. Sato (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2023.05.23.541891 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.0.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:9.4%,D:89.5%],F:0.6%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.1%[S:15.7%,D:79.4%],F:1.7%,M:3.2%,n:1614 |