配列名:Sorghum_bicolor_NCBIv3
ゲノム配列名 | Sorghum_bicolor_NCBIv3 | 系統名 | BTx623 |
配列数 | 867 | 染色体数 | 2n = 2x = 20 |
配列長 (bp) | 708,735,318 | N50長 (bp) | 68,658,214 |
遺伝子の数 | 47,110 | 遺伝子数由来ファイル | Sorghum_bicolor.Sorghum_bicolor_NCBIv3.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 47,110 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, 454 | 取得した配列量 | 8x |
アセンブリ方法 | ARACHNE modified v. 200721016 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 818 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Andrew H. Paterson (University of Georgia); John E. Mullet (Texas A&M University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature07723 10.1111/tpj.13781 |
データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:96.0%,D:2.0%],F:0.7%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.5%[S:70.5%,D:28.0%],F:0.8%,M:0.7%,n:1614 |