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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Sorghum bicolor , Sorghum , モロコシ, ソルガム, コーリャン

Sorghum bicolor

Genome Assembly ID:t4558.G001

配列名:Sorghum_bicolor_NCBIv3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Sorghum_bicolor_NCBIv3 系統名 BTx623
配列数 867 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 708,735,318 N50長 (bp) 68,658,214
遺伝子の数 47,110 遺伝子数由来ファイル Sorghum_bicolor.Sorghum_bicolor_NCBIv3.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 47,110 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, 454 取得した配列量 8x
アセンブリ方法 ARACHNE modified v. 200721016 推定ゲノムサイズ (Mb) 818
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Andrew H. Paterson (University of Georgia); John E. Mullet (Texas A&M University) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature07723
10.1111/tpj.13781
データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:96.0%,D:2.0%],F:0.7%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.5%[S:70.5%,D:28.0%],F:0.8%,M:0.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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