配列名:Sitalica_312_v2
ゲノム配列名 | Sitalica_312_v2 | 系統名 | Yugu1 |
配列数 | 336 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 405,737,341 | N50長 (bp) | 47,253,416 |
遺伝子の数 | 34,584 | 遺伝子数由来ファイル | Sitalica_312_v2.2.protein_primaryTranscriptOnly.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | ABI 3730xl | 取得した配列量 | 8.29x |
アセンブリ方法 | Arachne v.20071016 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 406 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jeffrey L Bennetzen (University of Georgia) | データソース名 | JGI Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nbt.2196 | データソースURL | https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Sitalica_v2_2 |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.7%[S:95.7%,D:2.0%],F:1.2%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.0%[S:96.1%,D:1.9%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614 |