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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Setaria italica , Foxtail millet , アワ

Setaria italica

Genome Assembly ID:t4555.G001

配列名:Sitalica_312_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Sitalica_312_v2 系統名 Yugu1
配列数 336 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 405,737,341 N50長 (bp) 47,253,416
遺伝子の数 34,584 遺伝子数由来ファイル Sitalica_312_v2.2.protein_primaryTranscriptOnly.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 3730xl 取得した配列量 8.29x
アセンブリ方法 Arachne v.20071016 推定ゲノムサイズ (Mb) 406
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jeffrey L Bennetzen (University of Georgia) データソース名 JGI Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/nbt.2196 データソースURL https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Sitalica_v2_2
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:95.7%,D:2.0%],F:1.2%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.0%[S:96.1%,D:1.9%],F:1.0%,M:1.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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