配列名:Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020
ゲノム配列名 | Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020 | 系統名 | inbred line Lo7 |
配列数 | 8 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 6,735,227,109 | N50長 (bp) | 899,925,126 |
遺伝子の数 | 34,441 | 遺伝子数由来ファイル | Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.HC.aa.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 10x Genomics, Hi-C | 取得した配列量 | 120x |
アセンブリ方法 | DeNovoMagic 3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 7,900 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)) | データソース名 | via e!DAL |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-021-00807-0 | データソースURL | https://edal.ipk-gatersleben.de/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |