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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Secale cereale , Winter rye , ライムギ

Secale cereale

Genome Assembly ID:t4550.G003

配列名:Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Secale_cereale_Lo7_RefSeq_RabanusWallace_etal_2020 系統名 inbred line Lo7
配列数 8 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 6,735,227,109 N50長 (bp) 899,925,126
遺伝子の数 34,441 遺伝子数由来ファイル Secale_cereale_Lo7_2018v1p1p1.pgsb.Feb2019.HC.aa.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 10x Genomics, Hi-C 取得した配列量 120x
アセンブリ方法 DeNovoMagic 3 推定ゲノムサイズ (Mb) 7,900
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Nils Stein (Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK)) データソース名 via e!DAL
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-021-00807-0 データソースURL https://edal.ipk-gatersleben.de/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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