配列名:GCA_002174835.2
ゲノム配列名 | GCA_002174835.2 | 系統名 | genotype Tift 23D2B1-P1-P5 |
配列数 | 52,059 | 染色体数 | 2n = 2x = 14 |
配列長 (bp) | 1,816,969,981 | N50長 (bp) | 240,570,548 |
遺伝子の数 | 38,579 | 遺伝子数由来ファイル | pearl_millet_pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 38,579 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 296.0x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,350 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | GenBank nucleotide: LKME00000000.2, GenBank assembly: GCA_002174835.2 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Xin Liu (BGI-Shenzhen), Yves Vigouroux (Institut de recherche pour le developpement), Xun Xu (BGI-Shenzhen) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nbt.3943 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:94.2%[S:91.3%,D:2.9%],F:3.8%,M:2.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:78.4%[S:75.2%,D:3.2%],F:12.0%,M:9.6%,n:1614 |