Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cenchrus americanus , Pearl millet , トウジンビエ

Cenchrus americanus

Genome Assembly ID:t4543.G001

配列名:GCA_002174835.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_002174835.2 系統名 genotype Tift 23D2B1-P1-P5
配列数 52,059 染色体数 2n = 2x = 14
配列長 (bp) 1,816,969,981 N50長 (bp) 240,570,548
遺伝子の数 38,579 遺伝子数由来ファイル pearl_millet_pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 38,579 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 296.0x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,350
シーケンシングの方法のコメント NA コメント GenBank nucleotide: LKME00000000.2, GenBank assembly: GCA_002174835.2
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rajeev K Varshney (International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics), Xin Liu (BGI-Shenzhen), Yves Vigouroux (Institut de recherche pour le developpement), Xun Xu (BGI-Shenzhen) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1038/nbt.3943 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:94.2%[S:91.3%,D:2.9%],F:3.8%,M:2.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:78.4%[S:75.2%,D:3.2%],F:12.0%,M:9.6%,n:1614

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット