Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Panicum miliaceum , Proso millet, Broomcorn millet , キビ

Panicum miliaceum

Genome Assembly ID:t4540.G001

配列名:vPm_0390_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 vPm_0390_v2 系統名 NA
配列数 1,306 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 854,793,052 N50長 (bp) 46,661,915
遺伝子の数 55,964 遺伝子数由来ファイル GCA_003046395.2_Pm_0390_v2_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS II 取得した配列量 87.88x
アセンブリ方法 Canu v1.7 推定ゲノムサイズ (Mb) 923
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jian-Kang Zhu (Chinese Academy of Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-08409-5 データソースURL https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/genbank/plant/Panicum_miliaceum/latest_assembly_versions/GCA_003046395.2_Pm_0390_v2/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット