Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Oryza brachyantha , Malo sina , イネ野生種 (brachyantha種)

Oryza brachyantha

Genome Assembly ID:t4533.G001

配列名:ObraRS2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ObraRS2 系統名 IRGC101232
配列数 60 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 263,329,681 N50長 (bp) 21,827,379
遺伝子の数 30,090 遺伝子数由来ファイル GCF_000231095.2_ObraRS2_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Sanger 取得した配列量 104x
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 298
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Rod A Wing(University of Arizona), Jun Wang(University of Copenhagen), Mingsheng Chen(Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms2596 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:97.4%,D:1.1%],F:0.8%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.4%[S:76.0%,D:23.4%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット