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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Oryza sativa , Rice, Indica rice, Japonica rice , イネ, イネ インディカ亜種, イネ ジャポニカ亜種

Oryza sativa

Genome Assembly ID:t4530.G013

配列名:GWHDRIN00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHDRIN00000000 系統名 subsp. japonica, cv. Nipponbare
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 385,710,679 N50長 (bp) 31,111,469
遺伝子の数 67,818 遺伝子数由来ファイル GWHDRIN00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 33.0 Gb (PacBio), 85.6 Gb (ONT), 36.4Gb (Hi-C)
アセンブリ方法 HiFiasm v0.18.5-r500, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qian Qian (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2023.08.003 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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